Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms