Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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