Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed5B2RPU8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms