Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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Atp8b5A3FIN4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Atp8b5A3FIN4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Atp8b5A3FIN4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Atp8b5A3FIN4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Atp8b5A3FIN4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Atp8b5A3FIN4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Atp8b5A3FIN4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atp8b5A3FIN4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms