Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tubb1A2AQ07 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tubb1A2AQ07 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms