Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pramef6A2A8M8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pramef6A2A8M8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pramef6A2A8M8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pramef6A2A8M8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pramef6A2A8M8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pramef6A2A8M8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms