Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Krtap1-3A2A588 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms