Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt27Q9Z320 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms