Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms