Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Lgr5Q9Z1P4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Lgr5Q9Z1P4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lgr5Q9Z1P4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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