Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Tomm40Q9QYA2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tomm40Q9QYA2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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