Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Trim44Q9QXA7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Trim44Q9QXA7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Trim44Q9QXA7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trim44Q9QXA7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trim44Q9QXA7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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