Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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