Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms