Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gde1Q9JL56 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gde1Q9JL56 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms