Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms