Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms