Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Slc28a3Q9ERH8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms