Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rnft1Q9DCN7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rnft1Q9DCN7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rnft1Q9DCN7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rnft1Q9DCN7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rnft1Q9DCN7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnft1Q9DCN7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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