Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pop7Q9DCH2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms