Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Swt1Q9DBQ9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Swt1Q9DBQ9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Swt1Q9DBQ9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Swt1Q9DBQ9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Swt1Q9DBQ9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Swt1Q9DBQ9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Swt1Q9DBQ9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Swt1Q9DBQ9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms