Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Smg9Q9DB90 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Smg9Q9DB90 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Smg9Q9DB90 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Smg9Q9DB90 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Smg9Q9DB90 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Smg9Q9DB90 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Smg9Q9DB90 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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