Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Med27Q9DB40 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms