Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Cldn22Q9D7U6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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