Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms