Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Trappc6bQ9D289 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc6bQ9D289 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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