Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syf2Q9D198 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms