Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms