Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Xrcc3Q9CXE6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Xrcc3Q9CXE6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Xrcc3Q9CXE6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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