Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Utp23Q9CX11 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms