Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms