Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms