Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ifitm3Q9CQW9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms