Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms