Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms