Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Abcg3Q99P81 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Abcg3Q99P81 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Abcg3Q99P81 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Abcg3Q99P81 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Abcg3Q99P81 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Abcg3Q99P81 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Abcg3Q99P81 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Abcg3Q99P81 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcg3Q99P81 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms