Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms