Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PtprtQ99M80 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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PtprtQ99M80 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprtQ99M80 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms