Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms