Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apobec3Q99J72 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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