Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Slc8b1Q925Q3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Slc8b1Q925Q3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Slc8b1Q925Q3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Slc8b1Q925Q3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Slc8b1Q925Q3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Slc8b1Q925Q3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Slc8b1Q925Q3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Slc8b1Q925Q3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Slc8b1Q925Q3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Slc8b1Q925Q3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Slc8b1Q925Q3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Slc8b1Q925Q3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Slc8b1Q925Q3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Slc8b1Q925Q3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Slc8b1Q925Q3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Slc8b1Q925Q3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Slc8b1Q925Q3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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Slc8b1Q925Q3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Slc8b1Q925Q3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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