Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms