Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms