Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pkn3Q8K045 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pkn3Q8K045 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pkn3Q8K045 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pkn3Q8K045 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pkn3Q8K045 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkn3Q8K045 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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