Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms