Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc9Q8CDN9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Lrrc9Q8CDN9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Lrrc9Q8CDN9 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc9Q8CDN9 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms