Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fbxo48Q8CAT8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Fbxo48Q8CAT8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Fbxo48Q8CAT8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fbxo48Q8CAT8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms