Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9F4

Gm9949, Predicted gene 9949, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9949Q8C9F4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms