Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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