Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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ChfrQ810L3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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ChfrQ810L3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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ChfrQ810L3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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